兩個風格各走極端的科學家－次方博士和D博士在世界上各領風騷，D博士認為要令世界得到真正和平，必須清治『有害』的人類，將世界重新定位，同時著力研究『改造人』計劃，將人體重新改造成沒有感覺的殺人機器以進行『人類清洗計劃』，最後被次方博士識破了他的計劃，利用強化裝備－『鬥神』軍團將D博士消滅…     當次方博士滿以為世界得到了和平之際，被消滅的Ｄ博士竟然利用『改造人』技術改造自己，更創造了虛擬世界『Destroyer』，將真實世界上有利用價值的人和物透過電腦程式拉進『Destroyer』裡，企圖與這個隱藏的世界製造大軍反攻真實世界，搶奪世界的控制權。     次方博士洞悉此事後，由於沒有進入『Destroyer』的技術所以一直,無法派出鬥神大軍直接擊破，最後派遣了病毒程式－拯救艦『次方』進入『Destroyer』企圖拯救被吸進去的生存者，D博士亦同時一邊製造改組人，一邊著力追擊『次方』，兩方進行一場超越時空、年代的爭霸之戰！
	劉備、關張、張飛一眾本來已經沉睡在歷史中的三國英雄，竟然復活過來！更成為別人的棋子，企圖利用這些三國英雄的力量，去侵佔現實世界！一名邪惡科學家Dr.D，為了自己的野心製造出虛擬世界「Destroyer末日港」，他不但把現實生活中有用的資源和人材，吸進虛擬世界中改造，更製造出靈魂轉生器，把三國戰將的靈魂，注入他所製造的肉體內，成為他的爪牙！幸好，正義的次方博士，研究出鬥神武裝，聯同一班正義之士，和想反抗Dr.D的三國英雄，組成拯救世界的反抗勢力，為人類的未來，甘願捨棄生命，與Dr.D來一場殊死的對抗戰！